Первый трехцветный государственный флаг Азербайджанской Республики, утвержденный в качестве национального символа постановлением Азербайджанской Демократической Республики от 9 ноября 1918 года, оставался символом государственности Азербайджана до апреля 1920 года, когда он был заменен флагом Азербайджанской Советской Социалистической Республики.
5 февраля 1991 года Верховный Совет Азербайджанской Республики, приняв Закон «О Государственном флаге Азербайджанской Республики», вновь придал трехцветному флагу статус Государственного флага Азербайджана. 18 октября 1991 года Азербайджанская Республика восстановила свой суверенитет, провозгласила себя правопреемницей Азербайджанской Демократической Республики, переняла ее государственные атрибуты, в том числе флаг.
17 ноября 2009 года Президент Азербайджанской Республики Ильхам Алиев подписал распоряжение об объявлении 9 ноября Днем Государственного флага. Праздник стал официальным выходным днем.
1 сентября 2010 года в столице Азербайджанской Республики — Баку была открыта площадь Государственного флага. Территория площади составляет 60 га, высота флагштока — 162 м, диаметр его основания — 3,2 м, а верхней части — 1,09 м; общий вес конструкции — 220 т; ширина флага — 35 м, длина — 70 м, общая площадь — 2450 м², вес — около 350 кг. Установленные на площади герб и карта Азербайджана изготовлены из позолоченной бронзы, так же как и текст государственного гимна, размещенный на основании флагштока. По инициативе Президента Азербайджана на площади создан музей Государственного флага.